MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015942	ACA	2	6	248799	248804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015942	CAC	2	6	248838	248843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_015942	CCAA	2	8	248892	248899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_015942	GTA	2	6	250362	250367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015942	TAT	2	6	250385	250390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015942	TTA	2	6	250406	250411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015942	TTG	2	6	254107	254112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015942	TCT	2	6	254129	254134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015942	TCA	2	6	254149	254154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015942	GGC	2	6	254202	254207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015942	A	7	7	254274	254280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015942	ATT	2	6	254304	254309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015942	AAT	2	6	254373	254378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015942	A	6	6	254385	254390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015942	CGG	2	6	254393	254398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015942	CCG	2	6	254403	254408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_015942	GAA	2	6	255744	255749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015942	TCC	2	6	255752	255757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_015942	GGT	2	6	255776	255781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015942	CAC	2	6	257510	257515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_015942	TTA	2	6	260355	260360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015942	GCG	2	6	260385	260390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015942	GGT	2	6	260404	260409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015942	TCG	2	6	261786	261791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015942	AAC	2	6	261834	261839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015942	CAC	2	6	261918	261923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_015942	T	6	6	262001	262006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015942	GTT	2	6	263993	263998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015942	GCA	2	6	264087	264092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015942	CCG	2	6	264097	264102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_015942	GGGC	2	8	264120	264127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
532	NC_015942	CGT	2	6	264143	264148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015942	GCG	2	6	264196	264201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015942	CAGTG	2	10	264203	264212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
535	NC_015942	A	6	6	264295	264300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015942	A	7	7	264314	264320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015942	GAG	3	9	264350	264358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015942	GC	3	6	271438	271443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015942	ATT	2	6	271448	271453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015942	ACT	2	6	271480	271485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015942	GGT	2	6	271491	271496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015942	GAAG	2	8	271572	271579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015942	CAT	2	6	271603	271608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015942	CGA	2	6	272425	272430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015942	TAT	2	6	272525	272530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015942	GGT	2	6	272612	272617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015942	TG	3	6	275248	275253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015942	GCAG	2	8	276349	276356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_015942	GTTAT	2	10	277344	277353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015942	GCC	2	6	277380	277385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_015942	TGGC	2	8	277605	277612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_015942	CTG	2	6	277640	277645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015942	GCG	2	6	277696	277701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015942	GGTGAT	2	12	277711	277722	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015942	GCA	2	6	284157	284162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015942	T	6	6	284639	284644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015942	TTC	2	6	284669	284674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015942	GGACC	2	10	284703	284712	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
559	NC_015942	GACG	2	8	285634	285641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_015942	C	6	6	285642	285647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
561	NC_015942	GTT	2	6	285650	285655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015942	TCT	2	6	285706	285711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015942	GC	3	6	286417	286422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_015942	TG	3	6	286430	286435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015942	CTG	2	6	286447	286452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015942	CGG	2	6	286544	286549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015942	AGTG	2	8	286572	286579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015942	CCG	2	6	286592	286597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_015942	CAT	2	6	286602	286607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015942	AG	3	6	286620	286625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015942	GAA	2	6	286638	286643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015942	CG	3	6	286656	286661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_015942	GCC	2	6	288252	288257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_015942	AT	3	6	294985	294990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015942	CTC	2	6	295993	295998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015942	AT	3	6	297647	297652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015942	TCC	2	6	298010	298015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_015942	TGG	2	6	298022	298027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015942	ATG	2	6	298098	298103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015942	ATA	2	6	298106	298111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015942	TGA	2	6	298221	298226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015942	TA	3	6	298253	298258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015942	TGA	2	6	298265	298270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015942	A	6	6	298287	298292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015942	GC	3	6	298315	298320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_015942	ATG	3	9	298324	298332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015942	CTCC	2	8	300266	300273	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
588	NC_015942	TA	3	6	300286	300291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015942	CTATG	2	10	300294	300303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
590	NC_015942	TAAT	2	8	300403	300410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015942	ATACA	2	10	300413	300422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_015942	ATT	2	6	300442	300447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015942	TGGG	2	8	300583	300590	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015942	G	6	6	300588	300593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015942	AGACT	2	10	302703	302712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
596	NC_015942	GCA	3	9	303395	303403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015942	GGCG	2	8	303443	303450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
598	NC_015942	CAG	2	6	303498	303503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015942	CAT	2	6	303518	303523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015942	TCA	2	6	303703	303708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015942	AGA	2	6	303715	303720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015942	TATT	2	8	303721	303728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015942	TCA	2	6	303798	303803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015942	GCG	2	6	303831	303836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015942	AGGG	2	8	305326	305333	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015942	GT	3	6	308489	308494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015942	TCC	2	6	308512	308517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015942	GA	3	6	309486	309491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015942	A	6	6	309515	309520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015942	CA	3	6	311174	311179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_015942	GCA	2	6	311216	311221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015942	GAA	2	6	312110	312115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015942	GAA	2	6	312121	312126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015942	ACTGC	2	10	312135	312144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
615	NC_015942	TTTA	2	8	312146	312153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015942	A	6	6	312825	312830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015942	TGG	2	6	316222	316227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015942	CAGACC	2	12	316293	316304	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
619	NC_015942	GC	3	6	316311	316316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_015942	GGATG	2	10	316497	316506	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015942	CGT	2	6	316545	316550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015942	TAAC	2	8	316586	316593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_015942	TCG	2	6	319940	319945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015942	T	7	7	319971	319977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015942	AGT	2	6	319987	319992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015942	GC	3	6	324905	324910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_015942	CTC	2	6	324938	324943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015942	GTC	2	6	325177	325182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015942	TAC	2	6	325189	325194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015942	C	6	6	325275	325280	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
631	NC_015942	GCCC	2	8	325295	325302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
632	NC_015942	GAAC	2	8	333466	333473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_015942	GCA	2	6	333537	333542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015942	AGC	2	6	333578	333583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015942	GCT	2	6	333584	333589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015942	GGC	2	6	333626	333631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015942	AGG	2	6	333670	333675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015942	TG	3	6	338068	338073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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